从数学集合的角度来解释的话，儒家文化与孔子思想是包含与被包含的关系，孔子思想处于儒家文化的核心地位，更是儒家文化的代表性思想文化。从文化发展的角度来看，儒家文化是基于孔子的思想发展兴盛起来的，孔子创立了儒家学派，孔子思想作为儒家文化的根系和精髓，然后经过孟子、荀子诸人的发展和完善，逐渐繁衍生息并且枝繁叶茂起来了，最终统治中国政治与思想文化界两千余年。
齐景公问政于孔子。孔子对曰：“君君、臣臣、父父、子子。”
儒家文化自孔子创立以后便始终处于发展的状态，从来不是固化的，孔子号称“弟子三千，贤者七十二”，人的思维是不同的，那么对于相同事物和问题的思考和领悟可能也不尽相同，那么孔子的弟子在以后的传道授业过程中，所传播的思想和文化也会有所差别。比如我们耳熟能详的“孔曰成仁，孟曰取义”，孔子首倡“仁、义、礼”，孟子承言“仁、义、礼、智”，董仲舒则谓“仁、义、礼、智、信”，终定儒家“五常”。儒家文化在不同的时代会突出不同的主题，在春秋时代，孔子希望“复周礼”，以德、礼治国；汉时，董仲舒为迎合皇帝以确认儒家的统治地位，“罢黜百家，独尊儒术”，以“天人感应”之说与“君权神授”相呼应，儒家又吸收法家，将法家作为维护儒家统治地位的工具；宋时，程朱理学发展逐渐系统化，成为所谓的“新儒学”，理学甚至可以说是已经脱离儒家自立门户；明时，王阳明先生又提出“心学”。
无善无恶心之体，有善有恶意之动，知善知恶是良知，为善去恶是格物。
如果是在孔子创立儒家学派之初，说孔子思想文化即代表了儒家文化，这是可以的。可是在经过长期的发展以后，儒家文化所包含的思想文化必然更加丰富，它不再仅仅局限与孔子的学说，孟子、荀子、董仲舒、程朱、王阳明诸人的思想精髓也逐渐融入到了儒家文化里，这时我们只能说孔子思想是儒家文化的精髓，是儒家文化的代表性思想，孔子思想与儒家文化的关系式也不再是等号，而是孔子思想包含于儒家文化之中。
儒家学说自孔子创立后，虽然始终处于发展状态，可是我们也知道，在发展过程中却有某些东西遭到了删除和阉割，或者是曲解，这是统治者出于自身利益的考虑，为了维护他们“合理合法”的统治地位，同时也是文化发展过程中的无奈。
应该说孔子的思想不是儒家文化的全部！
我们都知道，每一个思潮、文化，都会随着时间的发展被后人不断补充完善，进而才会形成较为系统、完善的体系。儒家文化也是如此！
孔子是儒家思想的创始人，他所提出的很多思想是儒家思想的核心。
儒家作为春秋时期诸子百家之一，最初并不像汉朝之后有那么大的影响力。比如统一六国的秦国，它所采用的主要是法家思想。
孔子是儒家学派创始人，他提出“仁”与“礼”、有教无类、孝道等，当然他的思想也有保守落后的部分。这是儒家思想的最初形态。
儒家学派另一个重要代表人物就是孟子，他在孔子思想的基础上进一步提出了施行仁政的主张，并提出“民贵君轻”思想；主张“政在得民”，反对苛政；主张给农民一定的土地，不侵犯农民劳动时间，宽刑薄税。
到了西汉，董仲舒兼采诸子百家，建立起新儒学。而“儒家”应该是在董仲舒提出“独尊儒术”之后才成为最有影响力的学派。他的核心是“天人感应”，“君权神授”。这应该是孔子怎么也没有想到的。
到了唐朝，韩愈，从维护封建统治出发，用儒家的天命论和封建纲常来反对佛道的观点。这进一步丰富了儒家思想的内涵。
宋朝朱熹是理学发展的集大成者，他也常常被与孔子并提，称为“朱子”。他的核心内容为：“理”是宇宙万物的本源，是第一性的；“气”是构成宇宙万物的材料，是第二性的。把“天理”和“人欲”对立起来，认为人欲是一切罪恶的根源，因此他提出“存天理，灭人欲”。这实际上是为封建等级秩序辩护。
到这个时候，儒家思想作为封建统治者的核心思想地位已牢不可破了！
后来明朝的王阳明、李贽，清朝的黄宗羲、顾炎武等人进一步的阐述才形成了我们现在看到的儒学的全部内涵。
所以，孔子的思想不能完全代表儒家文化，这是没毛病的。
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